公司治理与控制权争议的证据清单，可以围绕五个核心问题展开：谁有权、走了什么程序、形成了什么决议、控制权实际由谁行使、有无损害后果。据此归纳为五类证据：①主体资格与股权结构证据；②会议召集与决议程序证据；③印章、证照、账册的实际控制证据；④财务与经营往来证据；⑤电子数据与沟通记录。建议在争议初期就完成固定与公证，避免资料被单方控制后无法取得。
一、举证责任与整体思路：先定主张，再定清单
《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条规定，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。控制权争议通常混合了公司决议纠纷、股东知情权纠纷、公司证照返还纠纷、损害公司利益责任纠纷等多个案由，不同案由的举证重点并不相同。因此，证据准备的第一步不是"把材料都收齐"，而是先明确诉讼请求——是请求撤销股东会决议，还是请求返还公章，还是请求赔偿损失。请求不同，证据的"必要性"判断标准完全不同。
《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第九十条提示，当事人的陈述、与一方当事人有利害关系的证人证言等，不能单独作为认定案件事实的根据。这意味着股东之间的口头约定、单方陈述，必须由书面文件、资金流水或电子记录相互印证。
二、第一类：主体资格与股权结构证据
这一组证据解决"谁有资格主张权利、谁享有多少表决权"的问题，是全部争议的基础。建议准备：
- 公司章程的设立版本及历次修正案、章程修正案签署页；
- 股东名册、出资证明书；
- 工商登记内档（含设立及历次变更的全套材料）；
- 出资凭证：银行进账单、验资报告、非货币出资的评估报告与权属转移凭证；
- 股权转让协议、增资协议、股权代持协议、一致行动协议、表决权委托协议；
- 股东是否实际参与经营、领取分红的记录。
实务中，认缴出资未实缴、代持关系未书面化、章程修正案缺失签署页，是控制权争议最常见的三个"证据缺口"。出资与股东资格的认定，应以《公司法》及公司章程、股东名册、工商登记的记载为基础综合判断。
三、第二类：会议召集与决议程序证据
《公司法》（2023年修订）第二十六条规定，股东会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东可以自决议作出之日起六十日内请求人民法院撤销。《公司法》第二十七条则列举了决议不成立的四种情形，包括未召开会议、未对决议事项进行表决、出席人数或表决权数未达法定或章程要求、同意人数或表决权数未达要求。